La Cripta de la Virgen de la Asunción cuenta con 3 bóvedas y 18 tumbas de 1,5 metros, donde se depositaron al menos 110 cuerpos, procedentes de distintos rangos sociales. Se encontraron restos de perssonas criollas, mestizas y de raza negra.
El último espacio de esta cripta es un pozo antisísmico de seis metros de profundidad y cuatro de diámetro excavado en el pedregoso subsuelo de Lima.





